Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
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