Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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