Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpr55Q3UJF0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms