Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms