Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms