Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nom1Q3UFM5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms