Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Q3U1D9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Q3U1D9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U1D9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U1D9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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