Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms