Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trappc13Q3TIR1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trappc13Q3TIR1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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