Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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