Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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