Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms