Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms