Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms