Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps8Q0P5W1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms