Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col17a1Q07563 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms