Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms