Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms