Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col6a1Q04857 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms