Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms