Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Thbs2Q03350 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms