Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Hoxd1Q01822 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Hoxd1Q01822 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Hoxd1Q01822 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Hoxd1Q01822 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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