Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms