Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms