Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms