Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IhhP97812 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IhhP97812 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms