Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms