Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx1P81068 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx1P81068 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms