Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiitaP79621 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms