Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8a1P70704 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms