Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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