Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms