Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms