Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Acta1P68134 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms