Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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