Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps3P62908 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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