Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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