Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms