Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms