Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms