Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp4P59240 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms