Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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