Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmoP56726 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmoP56726 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SmoP56726 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SmoP56726 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SmoP56726 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SmoP56726 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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