Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp5P56399 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms