Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Atp5eP56382 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms