Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcanP55066 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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NcanP55066 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcanP55066 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcanP55066 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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