Protein–RNA interactions for Protein: P52503

Ndufs6, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs6P52503 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs6P52503 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms