Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms