Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms