Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sipa1P46062 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sipa1P46062 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms